模板:台湾野生动物保护区 - 维基百科，自由的百科全书

查论编中华民国野生动物保护区及重要栖息环境

北台湾	无尾港水鸟 · 台北市野雁 · 棉花屿、花瓶屿 · 兰阳溪口水鸟 · 新竹市滨海 · 双连埤 · 桃园高荣 · 翡翠水库食蛇龟 · 桃园观新藻礁 · 栖兰 · 观音海岸

中台湾	大肚溪口 · 樱花钩吻鲑 · 高美 · 丹大 · 观雾宽尾凤蝶 · 雪山坑溪 · 瑞岩溪 · 云林湖本八色鸟 · 中华白海豚

南台湾	猫屿海鸟 · 楠梓仙溪 · 四草 · 望安岛绿蠵龟产卵栖地 · 曾文溪口黑面琵鹭 · 鹿林山 · 浸水营 · 茶茶牙赖山 · 双鬼湖 · 塔山 · 嘉义鳌鼓

东台湾	新武吕溪鱼类 · 玉里 · 丹大 · 关山 · 双鬼湖 · 利嘉 · 海岸山脉 · 水琏

外岛	马祖列岛燕鸥

参见：台湾自然保护区域列表 · 台湾保育物种列表